Interní grantová agentura je odborný orgán univerzity, který se podílí na formování její výzkumné politiky, podporuje především zapojení studentů do vědy a výzkumu a finančně podporuje rozvoj vědy a výzkumu a propagaci výsledků studentů udělením interních grantů v rámci grantové soutěže.
Od roku 2008 je organizace soutěže Interní grantové agentury v kompetenci jednotlivých fakult univerzity.
Grantová rada Interní grantové agentury Zahradnické fakulty MENDELU je organizačním a výkonným orgánem grantové agentury. Grantová rada také sestavuje návrh seznamu grantových přihlášek dle jejich vědecké kvality, které doporučuje děkanovi k udělení interního grantu.